SOFTWARES
phenobook
Los programas de mejoramiento recolectan gran cantidad de información a través de la observación y registro de diferentes variables en ensayos a campo. A partir de dicha información se toman decisiones importantes sobre metodologías y genotipos evaluados. En muchos casos, estas tareas son realizadas por varias personas en diferentes lugares, tiempos y formas, agregando diferentes niveles de complejidad y error en la recolección de datos. Además, el procesamiento de datos puede llevar mucho tiempo y los errores de entrada pueden producir resultados no deseados.
En este caso les presentamos un software novedoso de código abierto llamado Phenobook (Crescente et al., 2017), una herramienta fácil, flexible e intuitiva para organizar, recopilar y guardar datos experimentales para análisis posteriores. Phenobook fue concebido para recopilar observaciones fenotípicas de una manera rentable y fácil de usar. Consiste en un software basado en la web para el diseño de experimentos, la entrada y visualización de datos y la exportación, combinado con una aplicación móvil para la recolección remota de datos.
Phenobook es una herramienta de software que se puede implementar fácilmente en los programas de mejoramiento y se espera que su adopción mejore los procesos involucrados al minimizar los errores de entrada, lo que resulta en una mayor calidad y confiabilidad de los resultados de la investigación.
Referencias
Crescente, J. M., Guidobaldi, F., Demichelis, M., Formica, M. B., Helguera, M., & Vanzetti, L. S. (2017). Phenobook: an open source software for phenotypic data collection. GigaScience, 6(4). https://doi.org/10.1093/gigascience/giw019
Sistema Integral de Administración para el Mejoramiento (SIAM)
La administración de los programas de mejoramiento, involucra procesos que requieren el acceso a información en grandes bancos de datos, en muchos casos compartidos por distintos grupos de trabajo. Para cada ensayo desarrollado, resulta estratégico documentar la mayor cantidad de datos agronómicos posibles sobre las líneas participantes del mismo. Esta información se utilizará luego para la toma de decisiones en la selección de líneas y como registro histórico de las actividades realizadas y prospectivas.
Por otra parte, el personal involucrado en tareas de mejoramiento requiere acceder a información específica de manera ágil, ordenada y resumida. SIAM permite a los programas de mejoramiento incorporar, procesar, almacenar y compartir la información generada durante todo el proceso de mejora y evaluación de germoplasma.
Estos sistemas de información permitirán reemplazar la escritura y transcripción de grandes volúmenes de datos provenientes de los libros de campo que conllevan un alto costo en recursos humanos y elevado riesgo de obtener datos con escasa integridad, así como el reemplazo de planillas de cálculo utilizadas para el almacenamiento local de la información por bases de datos distribuidas con el objetivo de mejorar la integridad, disponibilidad y seguridad de la información.
SIAM posibilita la administración integral del programa de mejoramiento mediante la administración de una base de datos de germoplasma, generación de bloques de cruzamientos y al seguimiento de filiales, confección de ensayos con diferentes diseños experimentales, obtención de planos, etiquetas y sobres de ensayos, análisis de resultados, etc.
SIAM incorpora en su esquema a “Phenobook” dedicado a la toma de observaciones a campo mediante un dispositivo móvil (teléfono inteligente/tableta). Tanto SIAM como Phenobook están siendo incorporados y evaluados por el PM de trigo de INTA con buenos resultados a la fecha (Crescente et al. 2016).
Referencias
Crescente JM, Guidobaldi F, Demichelis M, Salines J, Formica MB, Helguera M, Vanzetti L. (14-16 de septiembre de 2016). Incorporando a los programas de mejoramiento de trigo en la era de “Big data”. [Resumen de presentación de la conferencia]. Octavo Congreso Nacional de Trigo, Pergamino, Buenos Aires, Argentina.