MARCADORES
Rht-D1
Ellis et al. (2002) desarrollaron marcadores moleculares alelo específicos que permiten detectar las variantes alélicas Rht-D1a (alta) y Rht-D1b (enana). El marcador revela la presencia de una mutación C/T (Q62*) que genera un codón de stop TAG en el alelo Rht-D1b.
Los productos de PCR son visualizados en geles de agarosa al 2% teñidos con bromuro de etidio. La punta de flecha verde marca el fragmento de ADN de 264 pb perteneciente al alelo alto Rht-D1a (calles 1, 2, 3, 4, 6 y 7). La punta de flecha celeste marca el fragmento de 254 pb perteneciente sensible Rht-D1b (calle 5).
Primers:
Rht-D1a
DF 5′ CGC GCA ATT ATT GGC CAG AGA TAG 3′
WR2 5′ GGC CAT CTC GAG CTG CAC 3’
Rht-D1b
DF2 5′ GGC AAG CAA AAG CTT CGC G 3′
MR2 5′ CCC CAT GGC CAT CTC GAG CTG CTA 3’
Concentración final de productos utilizados en las reacciones de PCR:
1X Taq buffer (libre de Mg); dNTP: 200 µM c/u; MgCl2: 1.5 mM; primers: 0.2 µM c/u; Taq: 1 U; ADN genómico: 50-100 ng/reacción; Volumen final: 25 µl
Programa de PCR
Desnaturalización: 94 °C, 5 min; Touchdown 7 ciclos de 94 °C 30 seg, 65 °C 30 seg, 72 °C 1 min 20 seg; con una caída de 1°C de temperatura de annealing por ciclo. Luego, 30 ciclos de 94 °C 15 seg, 58 °C 15 seg, 72 °C 50 seg. Finalización con un paso de extensión: 72 °C 5 min.
Caracterización de la Variabilidad Genética presente en Variedades Argentinas de Trigo.
| Rht-D1 | Variedad |
|---|---|
|
a |
55CL, ACA 223, ACA 320, ACA 801, ACA 901, ACA 906, ACA 907, BAGUETTE 10, BAGUETTE 17, BAGUETTE 18, BAGUETTE 30, BAGUETTE 9, BAGUETTE P. 11, BARLETTA 77, BIOINTA 1001, BIOINTA 1003, BIOINTA 1004, BIOINTA 1005, BIOINTA 1006, BIOINTA 2004, BIOINTA 3003, BIOINTA 3004, BUCK AGP FAST, BUCK HUANCHEN, BUCK NAPOSTA, BUCK NORTEÑO, BUCK PUELCHE, DM AREX, DM ATLAX, DM CRONOX, DM ONIX, INIA CENTINELA, INIA CHURRINCHE, INIA TORCAZA, KLEIN 32, KLEIN ATLAS, KLEIN BRUJO, KLEIN CACIQUE, KLEIN CAPRICORNIO, KLEIN CARPINCHO, KLEIN CASTOR, KLEIN CENTAURO, KLEIN DONENRIQUE, KLEIN ESCORPION, KLEIN GAVILAN, KLEIN GLADIADOR, KLEIN GUERRERO, KLEIN IMPACTO, KLEIN LEON, KLEIN NUTRIA, KLEIN PANTERA, KLEIN PROTEO, KLEIN RAYO, KLEIN RENDIDOR, KLEIN TAURO, KLEIN TIGRE, KLEIN YARARA, KLEIN ZORRO, LE 2330, LE 2331, LE 2333, LE 2341, OLAETA ARTILLERO, PROINTA GRANAR, PROINTA GUAZU, PROINTA ISLA VERDE, PROINTA OASIS, RELMO SIRIRI, SINVALOCHO, SRN NOGAL, SY 200, SY 300 |
|
b |
ACA 201, ACA 202, ACA 903B, BAGUETTE 19, BAGUETTE 21, BAGUETTE 31, BIOINTA 1000, BIOINTA 1002, BIOINTA 2001, BIOINTA 3005, BUCK 75 ANIVERSARIO, BUCK BAQUEANO, BUCK BIGUA, BUCK BRASIL, BUCK CHACARERO, BUCK GUAPO, BUCK MALEVO, BUCK MANGRULLO, BUCK METEORO, BUCK PINGO, BUCK PRONTO, BUCK RANQUEL, BUCK TAITA, DM THEMIX, INIA CONDOR, KLEIN CHAJA, MARCOS JUAREZ INTA, PROINTA ELITE, PROINTA GAUCHO, SY 100 |
a = Alto; b = Bajo
Aclaración: Los datos de la caracterización molecular aquí mostrados pueden contener variaciones según el origen de las semillas utilizadas, se recomienda utilizarlos de manera orientativa.
Referencias
Ellis, M., Spielmeyer, W., Gale, K., Rebetzke, G., & Richards, R. (2002). “Perfect” markers for the Rht-B1b and Rht-D1b dwarfing genes in wheat. Theoretical and Applied Genetics, 105(6), 1038–1042. https://doi.org/10.1007/s00122-002-1048-4