MARCADORES
Ppd-D1
Beales et al. (2007) desarrollaron un marcador molecular codominante que permite detectar las variantes alélicas Ppd-D1a (insensible) y ppd-D1 (sensible). El marcador revela la presencia de una deleción de 2.089 pb en la región del promotor del gen Ppd-D1.
Productos de PCR separados en electroforesis en geles de agarosa al 2%.
Los productos de PCR son visualizados en geles de agarosa al 2% teñidos con bromuro de etidio. La punta de flecha roja marca el fragmento de ADN de 288 pb perteneciente al alelo insensible Ppd-D1a (calles 1, 5, 9, 10 y 11). La punta de flecha verde marca el fragmento de 414 pb perteneciente sensible ppd-D1 (calles 2, 3, 4, 6, 7 y 8). La punta de flecha amarilla señala el fragmento de 500 pb del marcador de peso molecular de 100 pb (Biodynamics).
Primers:
Ppd-D1F 5’ ACG CCT CCC ACT ACA CTG 3’
Ppd-D1R1 5’ GTT GGT TCA AAC CAG AGA GC 3’
Ppd-D1R2 5’ CAC TGG TGG TAG CTG AGA TT 3’
Concentración final de productos utilizados en las reacciones de PCR:
1X Taq buffer (libre de Mg); dNTP: 200 µM c/u; MgCl2: 1.5 mM; primers: 0.2 µM c/u; Taq: 1 U; ADN genómico: 50 – 100 ng/reacción; Volumen final: 25 µl
Programa de PCR
Desnaturalización: 94 °C, 5 min; Amplificación (40 ciclos); 94 °C 45 seg, 55 °C 45 seg, 72 °C 45 seg; Extensión: 72 °C 5 min
Caracterización de la Variabilidad Genética presente en Variedades Argentinas de Trigo.
| Ppd-D1 | Variedad |
|---|---|
|
s |
362, 55CL, 916, ACA 201, ACA 202, ACA 223, ACA 320, ACA 360, BAGUETTE 30, BAGUETTE 31, BAGUETTE 680, BAGUETTE 750, BARLETTA 77, BIOINTA 1002, BIOINTA 1004, BIOINTA 2004, BIOINTA 3003, BIOINTA 3004, BIOINTA 3005, BUCK AGP FAST, BUCK BAQUEANO, BUCK BIGUA, BUCK CHACARERO, BUCK DESTELLO, BUCK GUAPO, BUCK MALEVO, BUCK MANGRULLO, BUCK METEORO, BUCK NAPOSTA, BUCK NORTEÑO, BUCK PINGO, BUCK PRONTO, BUCK RESPLANDOR, DM ONIX, DM THEMIX, DM ÑANDUBAY, INIA CHURRINCHE, INIA TORCAZA, KLEIN 100 AÑOS, KLEIN CACIQUE, KLEIN CAPRICORNIO, KLEIN CARPINCHO, KLEIN GAVILAN, KLEIN GEMINIS, KLEIN MINERVA, KLEIN PANTERA, KLEIN PROTEO, KLEIN RENDIDOR, KLEIN SELENIO CL, KLEIN TITANIO CL, KLEIN VALOR, KLEIN YARARA, LE 2330, LE 2425, LG ARLASK, LG PAMPERO, MS INTA 623 CL, PROINTA GUAZU, SINVALOCHO, SY 100 |
|
i |
915, 920, ACA 308, ACA 602, ACA 604, ACA 608, ACA 801, ACA 901, ACA 903B, ACA 906, ACA 907, ACA 917, ALAMO, ALHAMBRA, BAGUETTE 10, BAGUETTE 17, BAGUETTE 18, BAGUETTE 19, BAGUETTE 21, BAGUETTE 450, BAGUETTE 501, BAGUETTE 550, BAGUETTE 620, BAGUETTE 802, BAGUETTE 9, BAGUETTE P. 11, BASILIO, BIOCERES 1008, BIOINTA 1000, BIOINTA 1001, BIOINTA 1003, BIOINTA 1005, BIOINTA 1006, BUCK 75 ANIVERSARIO, BUCK CAMBA, BUCK COLIHUE, BUCK CUMELEN, BUCK FULGOR, BUCK HUANCHEN, BUCK MUTICIA, BUCK PACIFICO, BUCK PEREGRINO, BUCK PUELCHE, BUCK RANQUEL, BUCK SAETA, BUCK TAITA, CEDRO, CEIBO, DM ALERCE, DM ALGARROBO, DM AREX, DM ATLAX, DM CRONOX, DM MAITEN, DM PEHUEN, DM SAUCE, FRESNO, GINGKO, GUAYABO, HO CARCARAÑA, HORNERO IS, INIA CENTINELA, INIA CONDOR, JACARANDA, KLEIN 32, KLEIN ATLAS, KLEIN BRUJO, KLEIN CASTOR, KLEIN CENTAURO, KLEIN CHAJA, KLEIN DONENRIQUE, KLEIN ESCORPION, KLEIN FAVORITO II, KLEIN GLADIADOR, KLEIN GUERRERO, KLEIN IMPACTO, KLEIN LEON, KLEIN NUTRIA, KLEIN POTRO, KLEIN PROMETEO, KLEIN RAYO, KLEIN TAURO, KLEIN TIGRE, KLEIN ZORRO, LAPACHO, LE 2331, LE 2333, LE 2341, LG ZAINO, MARCOS JUAREZ INTA, MS INTA 119, MS INTA 415, MS INTA 617, MS INTA 815, MS INTA 816, MS INTA BON. 817, PROINTA ELITE, PROINTA GAUCHO, PROINTA GRANAR, PROINTA ISLA VERDE, PROINTA OASIS, RAGT QUIRIKO, RELMO SIRIRI, SRN NOGAL, SY 109, SY 120, SY 200, SY 200, SY 211, SY 300, SY 330, TIMBO, TORDO IS |
s = alelo sensible; i = alelo insensible.
Aclaración: Los datos de la caracterización molecular aquí mostrados pueden contener variaciones según el origen de las semillas utilizadas, se recomienda utilizarlos de manera orientativa.
Referencias
Beales, J., Turner, A., Griffiths, S., Snape, J. W., & Laurie, D. A. (2007). A Pseudo-Response Regulator is misexpressed in the photoperiod insensitive Ppd-D1a mutant of wheat (Triticum aestivum L.). Theoretical and Applied Genetics, 115(5), 721–733. https://doi.org/10.1007/s00122-007-0603-4