MARCADORES
GNI-A1
La fertilidad de las flores es un determinante clave del número de granos por espiguillas en trigo. Durante la evolución del trigo, la fertilidad de las flores ha aumentado, de modo que el trigo pan produce de tres a cinco granos por espiguilla. El gen Grain Number Increase 1 (GNI1) mostró ser un contribuyente importante a la fertilidad de las flores.
El gen Grain Number Increase 1, codifica un factor de transcripción HD-Zip I y se expresa más abundantemente en los primordios de la flor más apical y en partes de la raquilla, actuando para inhibir la raquilla. Un análisis genético reveló que un alelo con función reducida para el gen GNI-A1 contribuye al aumento número de floretes fértiles por espiguilla (Sakuma et al., 2019).
En Argentina se observo un efecto significativo de este gen sobre el número de flores fértiles por espiguilla utilizando la población de mapeo K. Proteo x Klein Chajá en dos ambientes de evaluación.
Adicionalmente se observó una tendencia al aumento de número de granos por espiga, pero no llegando a ser estadísticamente significativa (Pretini et al. datos no publicados).
La variante alélica de alta fertilidad de espiga (105Y) se encuentra en diversos materiales comerciales Argentinos.
Marcador CAPS
Los productos de PCR digeridos con la enzima RsaI son visualizados en geles de agarosa al 2% teñidos con bromuro de etidio. Alelo 105Y asociado con alta fertilidad de espiga muestra bandas de 175 + (136 y 131) pb (calles 1, 3, 4 y 8) mientras que el alelo wt asociado con baja fertilidad de espiga muestra las bandas 311 +131 pb (calles 2, 5, 6 y 7) y los heterocigotas se observan con las bandas de 311 +175 + 131 pb. M marcador de peso molecular de 50 pb.
Primers
GNI-A1_RsaI_F1: 5’ GTA ACG GCT GGG AGA TGG AC 3’
GNI_A1_R2: 5’ CCA TTG GCG TGG ATC CCA G 3’
Concentración final de productos utilizados en las reacciones de PCR:
1X Taq buffer (libre de Mg); dNTP: 200 µM c/u; MgCl2: 1.5 mM; primers: 0.2 µM c/u; Taq: 1 U; ADN genómico: 50-100 ng/reacción; Volumen final: 25 µl
Programa de PCR:
Desnaturalización: 94 °C, 5 min; Amplificación (40 ciclos); 94 °C 45 seg, 61 °C 45 seg, 72 °C 45 seg; Extensión: 72 °C 5 min
Digestión con la enzima RSA I
10 µl de producto de PCR fueron incubados durante 2 hs a 37 ºC con 5 U de enzima Rsa I
Caracterización de la Variabilidad Genética presente en Variedades Argentinas de Trigo.
| GNI-A1 | Variedad |
|---|---|
|
105Y |
362, 365, 55CL, 916, ACA 201, ACA 303 PLUS, ACA 307, ACA 320, ACA 602, ACA 604, ACA 901, ACA 903B, ACA 906, ACA 910, ALAMO, BAGUETTE 21, BAGUETTE 30, BAGUETTE 31, BAGUETTE 620, BAGUETTE 680, BAGUETTE 750, BAGUETTE 802, BAGUETTE 9, BIOINTA 1000, BIOINTA 1001, BIOINTA 1002, BIOINTA 1003, BIOINTA 1005, BIOINTA 2001, BIOINTA 3004, BUCK BELLOCO, BUCK BIGUA, BUCK CAMBA, BUCK CHACARERO, BUCK CUMELEN, BUCK DESTELLO, BUCK FULGOR, BUCK MUTICIA, BUCK PACIFICO, BUCK PINGO, BUCK PUELCHE, BUCK RESPLANDOR, BUCK SAETA, CEIBO, DM ALERCE, DM AREX, DM ATLAX, DM CRONOX, DM FUSTE, DM MAITEN, DM PEHUEN, DM SAUCE, GARDELL, GINGKO, HORNERO IS, INIA CENTINELA, KLEIN 100 AÑOS, KLEIN ATLAS, KLEIN CACIQUE, KLEIN CAPRICORNIO, KLEIN CARPINCHO, KLEIN CHAJA, KLEIN FAVORITO II, KLEIN FLAMENCO, KLEIN GAVILAN, KLEIN GLADIADOR, KLEIN GUERRERO, KLEIN LEON, KLEIN MINERVA, KLEIN PANTERA, KLEIN PROMETEO, KLEIN RAYO, KLEIN SELENIO CL, KLEIN TITANIO CL, KLEIN YARARA, LE 2330, LE 2333, LENGA, LG ARLASK, MARCOS JUAREZ INTA, MS INTA 119, MS INTA 815, MS INTA 816, PROINTA GRANAR, PROINTA GUAZU, PROINTA ISLA VERDE, SINVALOCHO, SY 015, SY 109, SY 120, SY 200, SY 211, TIMBO, TORDO IS, VIRGILE |
|
105N |
915, 920, ACA 202, ACA 223, ACA 308, ACA 360, ACA 608, ACA 917, ALHAMBRA, AVELINO, AVISO, BAGUETTE 10, BAGUETTE 17, BAGUETTE 18, BAGUETTE 450, BAGUETTE 501, BAGUETTE 550, BAGUETTE P. 11, BARLETTA 77, BASILIO, BIOCERES 1008, BIOINTA 1004, BIOINTA 1006, BIOINTA 3003, BIOINTA 3005, BUCK 75 ANIVERSARIO, BUCK AGP FAST, BUCK BAQUEANO, BUCK BRASIL, BUCK COLIHUE, BUCK GUAPO, BUCK HUANCHEN, BUCK MALEVO, BUCK MANGRULLO, BUCK METEORO, BUCK NAPOSTA, BUCK NORTEÑO, BUCK PEREGRINO, BUCK PRONTO, BUCK RANQUEL, BUCK TAITA, CEDRO, DM ALGARROBO, DM ONIX, DM THEMIX, DM ÑANDUBAY, FRESNO, GUAYABO, HO CARCARAÑA, INIA CHURRINCHE, INIA CONDOR, INIA TORCAZA, JACARANDA, KLEIN 32, KLEIN BRUJO, KLEIN CASTOR, KLEIN CENTAURO, KLEIN ESCORPION, KLEIN GEMINIS, KLEIN IMPACTO, KLEIN LANZA, KLEIN POTRO, KLEIN PROTEO, KLEIN RENDIDOR, KLEIN SERPIENTE, KLEIN TAURO, KLEIN VALOR, LAPACHO, LE 2331, LE 2341, LE 2425, LG PAMPERO, LG ZAINO, MS INTA 415, MS INTA 617, MS INTA 623 CL, MS INTA BON. 514, MS INTA BON. 817, RAGT QUIRIKO, RELMO SIRIRI, SRN NOGAL, SY 330 |
105Y = Alta fertilidad; 105N = Baja fertilidad.
Aclaración: Los datos de la caracterización molecular aquí mostrados pueden contener variaciones según el origen de las semillas utilizadas, se recomienda utilizarlos de manera orientativa.
Referencias
Sakuma, S., Golan, G., Guo, Z., Ogawa, T., Tagiri, A., Sugimoto, K., Bernhardt, N., Brassac, J., Mascher, M., Hensel, G., Ohnishi, S., Jinno, H., Yamashita, Y., Ayalon, I., Peleg, Z., Schnurbusch, T., & Komatsuda, T. (2019). Unleashing floret fertility in wheat through the mutation of a homeobox gene. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(11), 5182–5187. https://doi.org/10.1073/pnas.1815465116