MARCADORES
Rht-B1
Ellis et al. (2002) desarrollaron marcadores moleculares alelo específicos que permiten detectar las variantes alélicas Rht-B1a (alta) y Rht-B1b (enana). El marcador revela la presencia de una mutación C/T (Q62*) que genera un codón de stop TAG en el alelo Rht-B1b.
Los productos de PCR son visualizados en geles de agarosa al 2% teñidos con bromuro de etidio. La punta de flecha verde marca el fragmento de ADN de 237 pb perteneciente al alelo alto Rht-B1a (calles 2, 3, 4 y 7). La punta de flecha celeste marca el fragmento de 237 pb perteneciente al alelo enano Rht-B1b (calles 1, 4, 5 y 6).
Primers:
Rht-B1a
BF 5′ GGT AGG GAG GCG AGA GGC GAG 3′
WR1 5′ CAT CCC CAT GGC CAT CTC GAG CTG 3’
Rht-B1b
BF
MR1 5′ CAT CCC CAT GGC CAT CTC GAG CTA 3′
Concentración final de productos utilizados en las reacciones de PCR:
1X Taq buffer (libre de Mg); dNTP: 200 µM c/u; MgCl2: 1.5 mM; primers: 0.2 µM c/u; Taq: 1 U; ADN genómico: 50-100 ng/reacción; Volumen final: 25 µl
Programa de PCR
Desnaturalización: 94 °C, 5 min; Touchdown 7 ciclos de 94 °C 30 seg, 65 °C 30 seg, 72 °C 1 min 20 seg; con una caída de 1°C de temperatura de annealing por ciclo. Luego, 30 ciclos de 94 °C 15 seg, 58 °C 15 seg, 72 °C 50 seg. Finalización con un paso de extensión: 72 °C 5 min.
Caracterización de la Variabilidad Genética presente en Variedades Argentinas de Trigo.
| Rht-B1 | Variedad |
|---|---|
|
a |
55CL, ACA 201, ACA 202, ACA 223, ACA 320, ACA 903B, BAGUETTE 10, BAGUETTE 17, BAGUETTE 18, BAGUETTE 19, BAGUETTE 21, BAGUETTE 31, BAGUETTE 9, BAGUETTE P. 11, BARLETTA 77, BIOINTA 1000, BIOINTA 1001, BIOINTA 1002, BIOINTA 2001, BIOINTA 3005, BUCK 75 ANIVERSARIO, BUCK BAQUEANO, BUCK BIGUA, BUCK BRASIL, BUCK CHACARERO, BUCK GUAPO, BUCK MALEVO, BUCK MANGRULLO, BUCK METEORO, BUCK NAPOSTA, BUCK NORTEÑO, BUCK PINGO, BUCK PRONTO, BUCK RANQUEL, BUCK TAITA, DM AREX, DM ONIX, INIA CONDOR, KLEIN 32, KLEIN ATLAS, KLEIN BRUJO, KLEIN CAPRICORNIO, KLEIN CENTAURO, KLEIN CHAJA, KLEIN ESCORPION, KLEIN IMPACTO, KLEIN NUTRIA, KLEIN PANTERA, KLEIN PROTEO, KLEIN RENDIDOR, KLEIN TAURO, KLEIN ZORRO, LE 2341, MARCOS JUAREZ INTA, OLAETA ARTILLERO, PROINTA ELITE, PROINTA GAUCHO, PROINTA GRANAR, PROINTA ISLA VERDE, PROINTA OASIS, SINVALOCHO, SRN NOGAL, SY 100, SY 200, SY 300 |
|
b |
ACA 801, ACA 901, ACA 906, ACA 907, BAGUETTE 30, BIOINTA 1003, BIOINTA 1004, BIOINTA 1005, BIOINTA 1006, BIOINTA 2004, BIOINTA 3003, BIOINTA 3004, BUCK AGP FAST, BUCK HUANCHEN, BUCK PUELCHE, DM ATLAX, DM CRONOX, DM THEMIX, INIA CENTINELA, INIA CHURRINCHE, INIA TORCAZA, KLEIN CACIQUE, KLEIN CARPINCHO, KLEIN CASTOR, KLEIN DONENRIQUE, KLEIN GAVILAN, KLEIN GLADIADOR, KLEIN GUERRERO, KLEIN LEON, KLEIN RAYO, KLEIN TIGRE, KLEIN YARARA, LE 2330, LE 2331, LE 2333, PROINTA GUAZU, RELMO SIRIRI |
a = Alto; b = Bajo.
Aclaración: Los datos de la caracterización molecular aquí mostrados pueden contener variaciones según el origen de las semillas utilizadas, se recomienda utilizarlos de manera orientativa.
Referencias
- Ellis, M., Spielmeyer, W., Gale, K., Rebetzke, G., & Richards, R. (2002). “Perfect” markers for the Rht-B1b and Rht-D1b dwarfing genes in wheat. Theoretical and Applied Genetics, 105(6), 1038–1042. https://doi.org/10.1007/s00122-002-1048-4